Coryphantha radians (biznaga partida de cuernos) Distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Vázquez-Benítez, B., D. N. Espinosa-Organista, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, I. Guzmán-Vázquez, L. U. Guzmán-Cruz, (2017)

Palabras clave: 2017, Cactaceae, Coryphantha radians, Distribución potencial, JM068, MaxEnt

Fecha de publicación: 15-03-2017, del metadato 15-03-2017

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Vázquez-Benítez, B., D. N. Espinosa-Organista, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, I. Guzmán-Vázquez, L. U. Guzmán-Cruz, (2017). 'Coryphantha radians (biznaga partida de cuernos). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM068, Distribución geográfica de algunas especies de los géneros Coryphantha (Engelm.) Lem. y Mammillaria Haw. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
      Fecha de publicación:
      15-03-2017
      Nombre del producto:
      Coryphantha radians (biznaga partida de cuernos) Distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/cra068dpgw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      Coryphantha radians es una biznaga de forma globosa de hasta 7 cm de altura que habita principalmente en matorrales xerófilos del Desierto Chihuahuense. Se modeló su distribución potencial utilizando MaxEnt, a partir de registros de colecta resultantes de un detallado control de calidad, y a partir de 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1, a una resolución espacial de 1km cuadrado.
      Propósito:
      Analizar la distribución geográfica de especies con alguna categoría de conservación de los géneros Coryphantha y Mammillaria. Caracterizar la distribución geográfica de especies de Coryphantha listadas en la NOM-059-SEMARNAT-2011. Definir áreas de endemismo para especies de ambos géneros.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=068
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1969-2012
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -103.237487792969, (Este) -98.0210189819336, (Norte) 24.722900390625, (Sur) 19.0397930145264
    6. Palabras clave
      Tema:
      2017, Cactaceae, Coryphantha radians, Distribución potencial, JM068, MaxEnt
      Lugar:
      Aguascalientes, Camacho-Gruñidora, Coahuila de Zaragoza, Distrito Federal, Fresnillos-Yesca, Guanajuato, Hidalgo, Jalisco, La Tula, Lago de Patzcuaro-Cuitzeo y Lago de Yuriria, Matehuala, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nuevo León, Presa San José-Los Pilares, Puebla, Querétaro de Arteaga, República Mexicana, Río Atoyac-A, Río Cazones, Río Cutzamala, Río Grande de Amacuzac, Río Juchipila, Río Laja, Río Lerma-Chapala, Río Lerma-Salamanca, Río Lerma-Toluca, Río Moctezuma, Río Pánuco, Río Santiago Guadalajara, Río Tamesí, Río Tamuín, Río Tecolutla, Río Tuxpan, Río Verde Grande, San Luis Potosí, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Zacatecas
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Caryophyllales, Cactaceae, Coryphantha, Coryphantha radians, biznaga partida de cuernos, biznaga partida huevos de coyote
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'

        19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Caryophyllales: Cactaceae: Coryphantha: ()

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/cra068dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/cra068dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3k, ArcMap 10.1, Dell T7600, Intel® Xeon ® CPU E5-2620, 2.0GHz, RAM 16.0 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados

      Coryphantha radians (biznaga partida de cuernos) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Página de enciclovida para Coryphantha radians a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 8186ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

      Coryphantha radians (biznaga partida de cuernos) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se obtuvieron registros provenientes de distintas fuentes de información. Se validó la nomenclatura taxonómica de los registros. Se realizó una validación geográfica de los registros. Se modeló con MaxEnt. Primero se generó un modelo de prueba y posteriormente se generó un modelo definitivo utilizando las capas climáticas que más contribuyeron al modelo de prueba. Se utilizó un subconjunto de registros no autocorrelacionados entre si y que además tuvieran el menor sesgo geográfico posible. Se utilizaron 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1. Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998).
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • G. Arias, Vázquez-Benítez, B., I. Guzmán, U. Guzmán, (2017), 'Distribución geográfica de algunas especies de los géneros Coryphantha (Engelm.) Lem. y Mammillaria Haw. (Cactaceae)', versión: 1, Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM068,

      • CNA, (1998), 'Cuencas Hidrológicas (CNA)', Escala 1:250000. Comisión Nacional del Agua, México.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/hidro/chidro/cue250kgw.

      • Phillips, S., R. Anderson, R. Schapire, M. Dudick, 'Maxent software for species habitat modeling', versión: 3.3.3 k, Princeton University and The Center of Biodiversity and Conservation, American Museum of natural History, USA. - Steven J. Phillips, Miroslav Dudík, Robert E. Schapire. A maximum entropy approach to species distribution modeling. In Proceedings of the Twenty-First International Conference on Machine Learning, pages 655-662, 2004. https://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/maxent_icml.pdf - Steven J. Phillips, Robert P. Anderson, Robert E. Schapire. Maximum entropy modeling of species geographic distributions. Ecological Modelling, 190:231-259, 2006. (datasets used in this paper are available below) http://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/ecolmod.pdf - Jane Elith, Steven J. Phillips, Trevor Hastie, Miroslav Dudík, Yung En Chee, Colin J. Yates. A statistical explanation of MaxEnt for ecologists. Diversity and Distributions, 17:43-57, 2011. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1472-4642.2010.00725.x/pdf, http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/

      • Cuervo-Robayo, A. P., O. Téllez-Valdés, M. Gómez, C. Venegas-Barrera, J. Manjarrez, E. Martínez-Meyer, (2013), 'An update of high-resolution monthly climate surfaces for Mexico', International Journal of Climatology, Volume 34, Issue 7 https://doi.org/10.1002/joc.3848,

      Procedimientos:

      • No aplica: Se obtuvieron registros provenientes de los herbarios de la Universidad Nacional Autónoma de México (MEXU), del Instituto Politécnico Nacional (ENCB), del Instituto de Ecología A.C. (IEB) y de observaciones particulares, entre otras colecciones y observaciones. La nomenclatura taxonómica se validó tomando como referencia diccionarios de autoridad taxonómica. Se compararon las descripciones de localidad para establecer un enunciado único de descripción estandarizado para dos o más localidades con variantes sintácticas u ortográficas. El número de registros se redujo mediante una búsqueda de combinaciones única. La información geográfica se validó por revisión contra estándares geoestadísticos del Inegi y de GoogleEarth. Se eliminaron datos atípicos y homotípicos. La información taxonómica fue validada siguiendo el estándar de las páginas web The Plant List (www.theplantlist.org) y Tropicos (www.tropicos.org). Los nombres de los autores de cada especie se homogeneizaron de acuerdo con Villaseñor et al (2008). La sinonimia taxonómica se adoptó del criterio propuesto en Guzmán et al (2003) y Hunt et al (2006) y sus actualizaciones posteriores (Guzmán et al, en prep.). Las localidades fueron verificadas por comparación con el nomenclátor de localidades de México (INEGI), mediante el seguimiento de rutas en Google Earth versión 7.1.2.2014 (Google Inc., 2013) y por verificación de datos en campo. Se reconocieron variantes ortográficas y sintácticas y se redujeron en lo posible a un solo enunciado. La base contiene 124 registros de los estados de Guanajuato, Hidalgo, México, Querétaro de Arteaga, San Luis Potosí, que sirvieron para generar el modelo. Se utilizaron las 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1, a una resolución espacial de 1km cuadrado. Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Las 19 capas de información climática se recortaron con base en una región M que se definió de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Las cuencas seleccionadas fueron, Mateuala, Presa San José-Los Pilares, San Luis Potosí, Rio Verde Grande, Rio Tamuín, Rio Lerma-Salamanca, Rio Laja, Rio Moctezuma y Rio Lerma-Toluca. La modelación se realizó con MaxEnt (MAxEnt versión 3.3 Phillips et al. 2004 usando 75% de los datos para entrenar el modelo y el restante 25% para validarlo. El modelo de nicho se ejecutó con la opción Jacknife. El modelo fue ejecutado con los parámetros básicos establecidos por defecto, con excepción del tamaño relativo de la muestra para contrastar el modelo (random test percentage = 25) y el número máximo de puntos de respaldo (Max number of background points = 10000). En los parámetros avanzados se seleccionaron todas las opciones de salida y se adoptaron todos los parámetros por defecto, con excepción de la regla aplicada al recorte del modelo (Umbral de corte 0.2771), en la cual se seleccionó el recorte del décimo percentil (Apply threshold rule = 10 percentile training presence). Los parámetros experimentales se adoptaron por defecto, con excepción de la escritura de las predicciones de respaldo (Write background predictions). El formato de salida de los datos fue logístico y el archivo de tipo ASC. Las variables usadas en el modelo final fueron edt, ep, pa, pcc, pcf, pcll, pcs, ppll, tppf. El modelo indicó que las variables que más contribuyen a la construcción del modelo, sin correlación significativa entre ellos, son la precipitación del trimestre más frio (pcf), la precipitación del trimestre más lluvioso (pcll), la precipitación del periodo más lluvioso (ppll), entre otras. El modelo produjo áreas con una probabilidad máxima de 0.89348 de encontrar a la especie dentro de su ambiente típico, con un ajuste de 0.902 en el área bajo la curva (AUC), según la curva ROC. El área de mayor probabilidad de encontrar a la especie es la cuenca del Rio Moctezuma.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      675
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: CRA068DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      Value Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      cra068dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      15-03-2017
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones

COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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