Coryphantha pallida (chiche de coneja) Distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)

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Información de identificación
1. Referencia
  
  Información de referencia:
  
  Autor:
  
  Vázquez-Benítez, B., D. N. Espinosa-Organista, G. Montaño-Arias, I. H. Salgado-Ugarte, I. Guzmán-Vázquez, L. U. Guzmán-Cruz, (2017). 'Coryphantha pallida (chiche de coneja). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM068, Distribución geográfica de algunas especies de los géneros Coryphantha (Engelm.) Lem. y Mammillaria Haw. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
  
  Fecha de publicación:
  
  15-03-2017
  
  Nombre del producto:
  
  Coryphantha pallida (chiche de coneja) Distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)
  
  Formato de representación geográfica:
  
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  
  Información complementaria:
  
  Escala: 1:1000000
  
  Acceso en línea:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/cpa068dpgw.html
2. Descripción
  
  Resumen:
  
  Coryphantha pallida es una biznaga de forma globosa de hasta 10 cm de altura que habita principalmente en matorrales xerófilos de Selvas Cálido Secas. Se modeló su distribución potencial utilizando MaxEnt, a partir de registros de colecta resultantes de un detallado control de calidad, y a partir de 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1, a una resolución espacial de 1km cuadrado.
  
  Propósito:
  
  Analizar la distribución geográfica de especies con alguna categoría de conservación de los géneros Coryphantha y Mammillaria. Caracterizar la distribución geográfica de especies de Coryphantha listadas en la NOM-059-SEMARNAT-2011. Definir áreas de endemismo para especies de ambos géneros.
  
  Información suplementaria:
  
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=068
3. Periodo de validez de los datos
  
  Fecha y hora:
  
  No aplica
  
  Vigencia:
  
  1901-2012
4. Estado de la información
  
  Progreso:
  
  Terminado
  
  Mantenimiento:
  
  No planeado
5. Dominio espacial
  
  Descripción de la extención geográfica:
  
  República Mexicana
  
  Coordenadas extremas:
  
  (Oeste) -98.9416809082031, (Este) -94.6335144042969, (Norte) 19.6970062255859, (Sur) 16.9221153259277
6. Palabras clave
  
  Tema:
  
  2017, Cactaceae, Coryphantha pallida, Distribución potencial, JM068, MaxEnt
  
  Lugar:
  
  Guerrero, Isla, México, Morelos, Oaxaca, Puebla, República Mexicana, Río Atoyac-A, Río Atoyac-B, Río Balsas-Mezcala, Río Coatzacoalcos, Río Grande de Amacuzac, Río Jamapa y otros, Río Moctezuma, Río Nautla y otros, Río Omotepec o Grande, Río Papaloapan, Río Tecolutla, Río Tehuantepec, Río Tlapaneco, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  
  Tema: Magnoliopsida, Caryophyllales, Cactaceae, Coryphantha, Coryphantha pallida, biznaga partida chiche de coneja, biznaguita, chiche de coneja
  
  Sistema taxonómico:
  
  Clasificación:
  
  Fuente:
  
  'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.'
  
  19810000. Cronquist, A., (1981), 'An Integrated System of Classification of Flowering Plants.', Columbia University Press., New York, Estados Unidos.
  
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  
  Clasificación:
  
  Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Caryophyllales: Cactaceae: Coryphantha: Coryphantha pallida (biznaga partida chiche de coneja, biznaguita, chiche de coneja)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  Importante:
  
  Se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
11. Contacto
12. Vista previa
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/cpa068dpgw
  
  Descripción:
  
  171 x 132 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
  
  Nombre del recurso:
  
  http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/cpa068dpgw
  
  Descripción:
  
  1002 x 774 píxeles
  
  Formato:
  
  image/png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  MaxEnt 3.3.3k, ArcMap 10.1, Dell T7600, Intel® Xeon ® CPU E5-2620, 2.0GHz, RAM 16.0 GB, Windows 7
16. Documentos relacionados
  
  Página de enciclovida para Coryphantha pallida a nivel de especie
  
  Enlace por idcatalogo 8177ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/
  
  Coryphantha pallida (chiche de coneja) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)
  
  Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
  
  Coryphantha pallida (chiche de coneja) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)
  
  Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Gabinete
3. Cobertura del tema
  Se obtuvieron registros provenientes de distintas fuentes de información. Se validó la nomenclatura taxonómica de los registros. Se realizó una validación geográfica de los registros. Se modeló con MaxEnt. Primero se generó un modelo de prueba y posteriormente se generó un modelo definitivo utilizando las capas climáticas que más contribuyeron al modelo de prueba. Se utilizó un subconjunto de registros no autocorrelacionados entre si y que además tuvieran el menor sesgo geográfico posible. Se utilizaron 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1. Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998).
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  
  G. Arias, Vázquez-Benítez, B., I. Guzmán, U. Guzmán, (2017), 'Distribución geográfica de algunas especies de los géneros Coryphantha (Engelm.) Lem. y Mammillaria Haw. (Cactaceae)', versión: 1, Facultad de Estudios Superiores Zaragoza, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM068,
  
  CNA, (1998), 'Cuencas Hidrológicas (CNA)', Escala 1:250000. Comisión Nacional del Agua, México.http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/hidro/chidro/cue250kgw.
  
  Phillips, S., R. Anderson, R. Schapire, M. Dudick, 'Maxent software for species habitat modeling', versión: 3.3.3 k, Princeton University and The Center of Biodiversity and Conservation, American Museum of natural History, USA. - Steven J. Phillips, Miroslav Dudík, Robert E. Schapire. A maximum entropy approach to species distribution modeling. In Proceedings of the Twenty-First International Conference on Machine Learning, pages 655-662, 2004. https://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/maxent_icml.pdf - Steven J. Phillips, Robert P. Anderson, Robert E. Schapire. Maximum entropy modeling of species geographic distributions. Ecological Modelling, 190:231-259, 2006. (datasets used in this paper are available below) http://www.cs.princeton.edu/~schapire/papers/ecolmod.pdf - Jane Elith, Steven J. Phillips, Trevor Hastie, Miroslav Dudík, Yung En Chee, Colin J. Yates. A statistical explanation of MaxEnt for ecologists. Diversity and Distributions, 17:43-57, 2011. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1472-4642.2010.00725.x/pdf, http://www.cs.princeton.edu/~schapire/maxent/
  
  Cuervo-Robayo, A. P., O. Téllez-Valdés, M. Gómez, C. Venegas-Barrera, J. Manjarrez, E. Martínez-Meyer, (2013), 'An update of high-resolution monthly climate surfaces for Mexico', International Journal of Climatology, Volume 34, Issue 7 https://doi.org/10.1002/joc.3848,
  Procedimientos:
  
  No aplica: Se obtuvieron registros provenientes de los herbarios de la Universidad Nacional Autónoma de México (MEXU), del University of Texas Austin Lundell Herbarium (LL) y de observaciones particulares, entre otras colecciones y observaciones. La nomenclatura taxonómica se validó tomando como referencia diccionarios de autoridad taxonómica. Se compararon las descripciones de localidad para establecer un enunciado único de descripción estandarizado para dos o más localidades con variantes sintácticas u ortográficas. El número de registros se redujo mediante una búsqueda de combinaciones única. La información geográfica se validó por revisión contra estándares geoestadísticos del Inegi y de GoogleEarth. Se eliminaron datos atípicos y homotípicos. La información taxonómica fue validada siguiendo el estándar de las páginas web The Plant List (www.theplantlist.org) y Tropicos (www.tropicos.org). Los nombres de los autores de cada especie se homogeneizaron de acuerdo con Villaseñor et al (2008). La sinonimia taxonómica se adoptó del criterio propuesto en Guzmán et al (2003) y Hunt et al (2006) y sus actualizaciones posteriores (Guzmán et al, en prep.). Las localidades fueron verificadas por comparación con el nomenclátor de localidades de México (INEGI), mediante el seguimiento de rutas en Google Earth versión 7.1.2.2014 (Google Inc., 2013) y por verificación de datos en campo. Se reconocieron variantes ortográficas y sintácticas y se redujeron en lo posible a un solo enunciado. La base contiene 22 registros del estado de Puebla, que sirvieron para generar el modelo. Se utilizaron las 19 variables climáticas elaboradas con los programas ANUSPLIN 4.3 y ANUCLIM 6.1, a una resolución espacial de 1km cuadrado. Se definió una región de modelado M de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Las 19 capas de información climática se recortaron con base en una región M que se definió de acuerdo con la carta de cuencas y regiones hidrológica de la Comisión Nacional del Agua (CNA, 1998). Las cuencas seleccionadas fueron, en este caso, las del Rio Atoyac-A y la del Rio Papalopan. La modelación se realizó con MaxEnt (MAxEnt versión 3.3 Phillips et al. 2004 usando 75% de los datos para entrenar el modelo y el restante 25% para validarlo. El modelo de nicho se ejecutó con la opción Jacknife. El modelo fue ejecutado con los parámetros básicos establecidos por defecto, con excepción del tamaño relativo de la muestra para contrastar el modelo (random test percentage = 25) y el número máximo de puntos de respaldo (Max number of background points = 10000). En los parámetros avanzados se seleccionaron todas las opciones de salida y se adoptaron todos los parámetros por defecto, con excepción de la regla aplicada al recorte del modelo (Umbral de corte 0.1135), en la cual se seleccionó el recorte del décimo percentil (Apply threshold rule = 10 percentile training presence). Los parámetros experimentales se adoptaron por defecto, con excepción de la escritura de las predicciones de respaldo (Write background predictions). El formato de salida de los datos fue logístico y el archivo de tipo ASC. Las variables usadas en el modelo final fueron iso, odt, pa, pcc, pcf, pcll, pcs, ppll. El modelo indicó que las variables que más contribuyen a la construcción del modelo, sin correlación significativa entre ellos, son la precipitación del trimestre más lluvioso (pcll), la oscilación diurna de la temperatura (odt), la precipitación del trimestre más seco (pcs), entre otras. El modelo produjo áreas con una probabilidad máxima de 0.800304 de encontrar a la especie dentro de su ambiente típico, con un ajuste de 0.971 en el área bajo la curva (AUC), según la curva ROC. El área de mayor probabilidad de encontrar a la especie son las cuencas delRio Atoyac-A y la del Rio Papaloapan.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  
  Tipo de objetos punto y vectores:
  
  G-polygon
  
  Número de puntos o vectores:
  
  189
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  
  Geográficas:
  
  Resolución de la latitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Resolución de la longitud:
  
  0.0174532925199433
  
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  
  Decimal degrees
  
  Modelo geodésico:
  
  Datum horizontal:
  
  WGS84
  
  Elipsoide:
  
  WGS84
  
  Semieje mayor:
  
  6378137.000000
  
  Denominador del factor de achatamiento:
  
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)

Atributos no espaciales

Descripción detallada

Nombre: CPA068DPGW.DBF

Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

Fuente: No conocido

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
Value	Numérico	Datos del proyecto	Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia.	-

Descripción resumida

Distribución de la información
1. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México
  
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  cpa068dpgw
3. Responsabilidad
  La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  
  ESRI Shapefile (SHP), 1.00 MB
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/geo/cpa068dpgw.zip
  
  Google Earth (KML)
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/maps/kmz/cpa068dpgw.kmz
  
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  15-03-2017
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  
  Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica
  
  ssig@conabio.gob.mx
  
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
  
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México
  
  Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931
  
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Coryphantha pallida (chiche de coneja) Distribución potencial (Vázquez-Benitez et al., 2017)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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