Carica papaya (papaya) silvestre. Distribución potencial (Chávez-Pesqueira et al. 2016)

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Información de identificación
1. Referencia
  Información de referencia:
  Autor:
  Chávez-Pesqueira, M., J. Nuñez-Farfán, A. Wegier-Briuolo, A. Casas-Fernández, V. Alavez- Gómez, (2016). 'Carica papaya (papaya) silvestre. Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Instituto de Ecología, Universidad Nacional Autónoma de México.. Proyecto: WQ003, Análisis para la determinación de los centros de origen y diversidad genética de Carica papaya (Caricaceae). Proyecto financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. Ciudad de México.
  Fecha de publicación:
  18-04-2017
  Nombre del producto:
  Carica papaya (papaya) silvestre. Distribución potencial (Chávez-Pesqueira et al. 2016)
  Formato de representación geográfica:
  Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
  Información complementaria:
  Escala: 1:1000000
  Acceso en línea:
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/cpawq003dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
2. Descripción
  Resumen:
  El siguiente dato geoespacial muestra la distribución potencial de la papaya silvestre, Carica papaya, obtenida por medio del modelo de su nicho ecológico con el programa Maxent.
  Propósito:
  El dato geoespacial se generó con el fin de obtener información sobre la distribución potencial de la papaya silvestre, relevante para la determinación de su centro de origen, diversidad y domesticación.
  Información suplementaria:
  Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=WQ&Numero=003
3. Periodo de validez de los datos
  Fecha y hora:
  [Fecha no disponible]
  Vigencia:
  2016-2017
4. Estado de la información
  Progreso:
  Terminado
  Mantenimiento:
  Otros
5. Dominio espacial
  Descripción de la extención geográfica:
  América del Norte, República Mexicana, América Central, Caribe y América del Sur
  Coordenadas extremas:
  (Oeste) -121.308334350586, (Este) -41.8166618347168, (Norte) 35.8833389282227, (Sur) -3.40000009536743
6. Palabras clave
  Tema (CNB.CLASES.PROYECTO):
  Grupo temático, WQ003
  Tema (CONABIO):
  Carica papaya, papaya silvestre, Distribución potencial, Nicho ecológico, Centro de origen, WQ003, 2016
  Localización (CONABIO):
  Panamá, Costa Rica, República mexicana, El Salvador, Cuba, Guatemala, Belice, Estados Unidos, Colombia, Ecuador, Venezuela, Nicaragua, Haití, República Dominicana, Puerto Rico
7. Taxonomía
  Palabras clave:
  Tema (taxon_conabio): Magnoliopsida, Violales, Caricaceae, Carica, Carica papaya, papaya, fruta bomba, lechosa
  Sistema taxonómico:
  Clasificación:
  Fuente:
  'Species plantarum 2: 1036. 1753.'
  17530000. Carl von Linnaeus, (1753), 'Species plantarum 2: 1036. 1753.', Imprensis Laurentii Salvi, Estocolmo, Suecia.
  Procedimiento taxonómico: No conocido
  Clasificación:
  Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Violales: Caricaceae: Carica: Carica papaya (papaya, fruta bomba, lechosa)
8. Herramienta de análisis
9. Condiciones de acceso
  Sin restricciones
10. Condiciones de uso
  No se permite utilizar estos datos con fines lucrativos y se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/mx/
11. Contacto
12. Vista previa
  Nombre del recurso:
  http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/layouts/cpawq003dpgw.png
  Descripción:
  Mapa ilustrativo de Carica papaya (papaya) silvestre. Distribución potencial (Chávez-Pesqueira et al. 2016). La proyección citada, es exclusiva para el diseño de esta imagen.
  Formato:
  png
13. Créditos y reconocimientos
14. Restricciones de uso
15. Sistema nativo
  ArcMap 9.3, Windows 7
16. Documentos relacionados
Calidad de la información
1. Precisión de los atributos no espaciales
2. Consistencia lógica
  Campo y Gabinete
3. Cobertura del tema
  Con base en los registros de ubicación geográfica de colectas previas (Chávez-Pesqueira et al. 2014, Chávez-Pesqueira, en revisión), las cinco nuevas poblaciones colectadas en este proyecto y los ejemplares determinados como silvestres de los herbarios visitados, se realizó un mapa de distribución potencial. Se emplearon las 19 variables bioclimáticas (Bioclim) de WorldClim (Hijmans et al. 2005) para realizar la modelación del nicho ecológico de C. papaya con el programa MaxEnt (Phillips et al. 2006), realizando 500 réplicas del algoritmo con bootstrap, utilizando aleatoriamente 80% de los puntos para calibración y 20% para evaluación, para realizar el método de AUC de ROC. Se emplearon un total de 90 sitios de presencia y para definir la región geográfica a modelar se consideró la distribución natural reportada para la especie. Los archivos de salida se visualizaron posteriormente con el programa ArcMap 9.3.
4. Precisión de los atributos espaciales
5. Procesamiento
  Fuentes:
  Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, K. Richardson, (2005), 'Global climate data', Escala 1:1000000. 1.4, Worldclim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas y las unidades y formato de los datos revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978., www.worldclim.org, University of California, Berkeley. U.S.A..
  Chávez-Pesqueira, M., (2016), 'Base de datos del proyecto: Análisis para la determinación de los centros de origen y diversidad genética de Carica papaya (Caricaceae).', Laboratorio de Genética Ecológica y Evolución del Instituto de Ecología de la UNAM, Herbarios visitados: Herbarios Nacional (MEXU) IB; Herbarios XAL, Instituto de Ecología A. C.; Herbario Centro de Investigación Científica de Yucatán, A, C. (CICY); Herbario Universidad Autónoma de Yucatán (UADY); Herbario Estación Biológica de Los Tuxtlas; Herbario Escuela Nacional de Ciencias Biológicas (ENCB), IPN y New York Botanical Garden Herbarium (NYBG)., Ciudad de México.
  Procedimientos:
  [Fecha no disponible]: 1) Se obtuvieron datos geográficos confiables (identificados por un experto y con referencia geográfica correcta) por medio de la revisión de ejemplares de herbario y salidas al campo de Carica papaya silvestre por parte del Laboratorio de Genética Ecológica y Evolución del Instituto de Ecología de la UNAM. 2) A partir de éstos datos y con las 19 capas climáticas de Worldclim se realizó un modelo de nicho ecológico con el programa Maxent 3.3.3k. 3) Se realizaron 500 réplicas del algoritmo con bootstrap, utilizando aleatoriamente 80% de los puntos para calibración y 20% para evaluación, para realizar el método de AUC de ROC. Se aplicó clamping. 5) Se obtuvo un valor AUC 0.978 +- 0.003, indicativo de un buen modelaje. 6) Adicionalmente, el archivo de salida en formato logístico se visualizó y analizó en ArcMap 9.3 corroborando la congruencia de los puntos de presencia con el área modelada. 7) El resultado fue un mapa de distribución potencial para la papaya silvestre. El modelo continuo se convirtió a binario usando el 10 percentile training presence con un valor de 0.246194.
6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
Atributos espaciales
1. Representacion espacial
2. Método de representacion espacial
  Vector
3. Información de vectores y puntos
  Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
  Tipo de objetos punto y vectores:
  G-polygon
  Número de puntos o vectores:
  9905
4. Información de imágenes
Sistema de referencia
1. Sistema de coordenadas (horizontal)
  Geográficas:
  Resolución de la latitud:
  0.0174532925199433
  Resolución de la longitud:
  0.0174532925199433
  Unidades de las coordenadas Geográficas:
  Decimal degrees
  Modelo geodésico:
  Datum horizontal:
  WGS84
  Elipsoide:
  WGS84
  Semieje mayor:
  6378137.000000
  Denominador del factor de achatamiento:
  298.257224
2. Sistema de coordenadas (vertical)
Atributos no espaciales
1. Descripción detallada
  Nombre: CPAWQ003DPGW.DBF
  Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie.
  Fuente: No conocido
  Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
  GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Representa los valores de Ausencia (0) y presencia (1) -
2. Descripción resumida
Distribución de la información
1. Información de contacto
  Jose Manuel Davila Rosas
  jdavila@conabio.gob.mx
  Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
2. Nombre de referencia
  cpawq003dpgw
3. Responsabilidad
  La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
4. Medios de distribución
  Digitales:
  ESRI Shapefile (SHP), compactado en ZIP, 319 MB
  Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Formato vectorial de almacenamiento de elementos geográficos y sus atributos asociados.
  Google Earth (KML), compactado como KMZ
  Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Los archivos KML representan datos geográficos para Google Earth, a menudo suelen distribuirse comprimidos como KMZ.
  Servicio de imágenes (WMS)
  Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Servicio Web Map Service. Los mapas de datos referenciados espacialmente producidos se generan normalmente en un formato de imagen como PNG, GIF o JPEG, pueden se vistos en un SIG
  Mapa digital interactivo
  Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)
  Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.
5. Medios de distribución especiales
6. Requisitos técnicos
  Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
7. Disponibilidad
Acerca de este documento
1. Fecha de creación o última actualización
  18-04-2017
2. Fecha de última revisión
3. Fecha de la siguiente revisión
4. Información de contacto
  Oswaldo Oliveros Galindo
  ooliver@conabio.gob.mx
  Administrador de Metadatos
  
  Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
  Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México
  Teléfono: 01 55 5004 3165 y (fax) 50044931
  Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.
5. Nombre del estándar de contenido
  FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
6. Versión del estándar de contenido
  FGDC-STD-001.1-1999
7. Uso horario
8. Condiciones de acceso
9. Condiciones de uso
10. Restricciones de seguridad o privacidad
11. Extensiones

Atributo	Descripción	Fuente [1]	Dominio [2]	Precisión [3]
GRIDCODE	Numérico	Datos del proyecto	Representa los valores de Ausencia (0) y presencia (1)	-

Carica papaya (papaya) silvestre. Distribución potencial (Chávez-Pesqueira et al. 2016)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

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