Ficus apollinaris (amate) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: López-Toledo, L., G. Ibarra-Manríquez, (04/10/2015)

Palabras clave: 2013, Ficus apollinaris, JM037, Nicho ecológico

Fecha de publicación: 04-10-2015, del metadato 04-10-2015

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      López-Toledo, L., G. Ibarra-Manríquez, (04/10/2015). 'Ficus apollinaris (amate). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Centro de Investigaciones en Ecosistemas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM037, Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
      Fecha de publicación:
      04-10-2015
      Nombre del producto:
      Ficus apollinaris (amate) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/fap037dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      Se modelo la distribución del nicho ecológico de Ficus apollinaris, dentro del proyecto JM037 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México.', apoyado por CONABIO. El objetivo fue desarrollar el modelo de nicho de la especie, para posteriormente Identificar las áreas con mayor riqueza de especies del género en México; utilizando como datos geográficos digitales los sitios de colecta georreferenciados de una base de datos generada por el proyecto y 14 variables ambientales no autocorrelacionadas obtenidas de Worldclim. Como región de referencia (M) se utilizaron las provincias bióticas (Ferrusquía-Villafranca 1990) en las que se ha colectado la especie, además de provincias en las que es posible su presencia. Las primeras incluyen Campechano-Petenense, Chiapasense, Neovolcanense, Oaxaquense, Sierra Madre Orientalense, Veracruzense, mientras que las segundas sólo incluye la provincia Pacifiquense. Este conjunto de datos fueron incorporados en el programa Maxent 3.3.3e para generar el modelo, el cual se procesó con el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del umbral 'Maximum training sensitivity plus specificity' (0.153).
      Propósito:
      Estimar la distribución del nicho ecológico de Ficus apollinaris en México
      Información suplementaria:
      Se utilizaron registros de presencia para desarrollar el modelo, así como las siguientes capas bioclimáticas de Worldclim: 1. Temperatura media anual (°C), 4. Estacionalidad de la Temperatura (°C), 6. Minima temperatura del mes más frío (°C), 7. Variación anual de la temperatura (°C), 8. Media la temperatura del cuarto mes más húmedo (°C), 10. Media de la temperatura del mes más cálido (°C), 11. Media de la temperatura del cuarto mes más frío (°C), 12. Precipitación anual (mm), 13. Precipitación del mes más húmedo (mm), 14. Precipitación del mes más seco (mm), 15. Estacionalidad de la precipitación (mm), 16. Precipitación del cuarto mes más húmedo (mm), 17. Precipitación del cuarto mes más seco (mm), 18. Precipitación del cuarto mes más cálido (mm). Del número de sitios utilizados para modelar, (3) se encuentran fuera del modelo Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=37
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1909-2007
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -105.253471374512, (Este) -86.8357162475586, (Norte) 25.7477779388428, (Sur) 14.8663167953491
    6. Palabras clave
      Tema:
      2013, Ficus apollinaris, JM037, Nicho ecológico
      Lugar:
      Belize, Campechano-Petenense, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chiapasense, Distrito Federal, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Neovolcanense, Nuevo León, Oaxaca, Oaxaquense, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, República de Guatemala, República Mexicana, San Luis Potosí, Sierra Madre Orientalense, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Veracruzense
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Urticales, Moraceae, Ficus, Ficus apollinaris, amate, amate blanco
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012'

        20120000. Ibarra-Manriquez, G., G. Cornejo-Tenorio, N. González-Castañeda, E.M. Piedra-Malagón, A. Luna, (2012), 'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012', Botanical Sciences, 90(4): 389-452,

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Urticales: Moraceae: Ficus: (, )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/fap037dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/fap037dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      R 2.15.1, ILWIS 3.4, QuantumGIS 1.7.4, Maxent 3.3.3e, ArcMap 10, Dell Vostro 470, Intel ® Core i7, 3.40GHz, RAM 4 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados

      Ficus apollinaris (amate) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Ficus apollinaris (amate) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Ficus apollinaris a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 29823ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se revisó la base de datos y se obtuvieron los registros de Ficus apollinaris, a los cuales se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012). Es decir, si los registros se distribuyen espacialmente al azar. Si los registros cumplen con esta prueba, estos son particionados en 75% para entrenar y 25% para validar el modelo. De lo contrario si los registros se distribuyen de forma agregada, se realiza un análisis de patrones utilizando Ilwis 3.4, para obtener la distancia en donde los registros ya no están auto correlacionados. A partir de la distancia obtenida en Ilwis, se hizo una cuadricula en Quantum GIS 1.7.4., la cuadrícula generada con la distancia, no permitó seleccionar un número de registros suficientes para generar el modelo en Maxent, por lo que se hizo una partición aleatoria de los datos en ArcMap (50% se utilizó para elaborar el modelo y el 50% restantes para validarlo). Para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie se utilizó el 50%, junto con las 20 variables ambientales; se metieron a Maxent 3.3.3e para general el modelo y el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. La región geográfica para la elaboración del modelo fue una región constituída por las provincias bióticas (Ferrusquía-Villafranca 1990) en las que la especie ha sido colectada y en las que es posible su presencia. Las primeras incluyeron Quintana Roo, Tabasco, Chiapas, Oaxaca, Veracruz, Puebla, Hidalgo y San Luis Potosí, mientras que las segundas incluyeron la provincia Pacifiquense. Por último la validación del modelo generado se hizo con una prueba binomial, para verificar si este es mejor que uno al azar (p < 0.5).
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Ferrusquía-Villafranca, I., (1990), 'Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos)', Escala 1:4000000. Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Geografía, México, D. F. Regionalización Biogeográfica, IV.8.10. Atlas Nacional de México. Vol. II., http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/fisica/rmorf4mgw

      • A. Luna-Nieves, Ibarra-Manríquez, G., L. López-Toledo, (2015), 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México', versión: 1, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM037,

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/

      Procedimientos:

      • No aplica: A los 34 registros (georreferenciados) de la especie, se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012), debido a que no pasó esta prueba, es decir, que los registros se encuentran agregados; se realizó un análisis de patrones en Ilwis 3.7, para calcular la probabilidad de 1.0 de encontrar un registro a cierta distancia donde los registros ya no están autocorrelacionados; la cuadrícula generada con la distancia, no permite seleccionar un número de resgistros suficientes para generar el modelo en Maxent, por lo que se hace una división aleatoria de los datos en ArcMap. De los 34 registros, se utilizó sólo el 50% (17 registros) para entrenar el modelo. El 50% restantes (17 registros) se utilizó para validar el modelo. Se emplearon 12 variables ambientales de la región de referencia (M) que incluye las provincias bióticas (Ferrusquia-Villafranca, 1990) en las que la especie ha sido colecta o es posible que esté presente. Las variables y los registros de entrenamiento se utilizaron para modelar la distribución de la especie en el programa Maxent 3.3.3e. La configuración en Maxent fue por default (Phillips y Dudik, 2008), excepto la desactivación de 'Extrapolate' y 'Do clamping' (comunicación personal T. Peterson) y el formato de salida del modelo logístico. El modelo se transformó a una capa booleana (presencia-ausencia), para esto se tomó como umbral de corte el maximum training sensitivity plus specificity (Liu, 2013). La validación del modelo se hizo con una prueba binomial para evaluar si este es mejor que al azar (p < 0.5). El número de éxitos se obtiene cuantificando cuantos registros de validación tienen valores logísticos por arriba del umbral de corte. ROC parcial AUC 0.81-1.7 , Prueba binomial <0.01 El número de sitios mencionados en la metodología no coincide con el número de sitios en la base de datos Darwin Core.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      863
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: FAP037DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      fap037dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      04-10-2015
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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