Ficus aurea (aguacatillo) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: López-Toledo, L., G. Ibarra-Manríquez, (04/10/2015)

Palabras clave: 2013, Ficus aurea, JM037, Modelo de nicho ecológico

Fecha de publicación: 04-10-2015, del metadato 04-10-2015

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      López-Toledo, L., G. Ibarra-Manríquez, (04/10/2015). 'Ficus aurea (aguacatillo). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Centro de Investigaciones en Ecosistemas, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México. Proyecto: JM037, Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). México.
      Fecha de publicación:
      04-10-2015
      Nombre del producto:
      Ficus aurea (aguacatillo) Distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/fau037dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      Se modeló la distribución de nicho ecológico de Ficus aurea, dentro del proyecto JM037 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México.', apoyado por CONABIO. El objetivo fue desarrollar un modelo de nicho de la especie, para posteriormente identificar las áreas con mayor riqueza de especies del género en México; utilizando como datos geográficos digitales los sitios de recolecta georreferenciados de una base de datos generada por el proyecto y 14 variables ambientales no autocorrelacionadas de Worldlcim. Como región de referencia (M) se utilizaron las provincias biogeográficas en donde se ha colectado la especie (Sierra Madre Orientalense, Neovolcanense, Nayaritense,Jalisqueno-Guerrerense,Oaxaquense, Pacifiquense, Campechano-Petenense, Chiapasense, Veracruzense, Sierra Madre Sureña), así como aquellas provincias en las que aunque nose ha colectado, es posible la presencia de la especie (Provincia Sierra Madre Occidentalense, Altiplanense y Sinaloense). Este conjunto de datos fueron incorporados en el programa Maxent 3.3.3e para generar el modelo, el cual se procesó con el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para eliminar las áreas con probabilidades por debajo del umbral 'Maximum training sensitivity plus specificity'. (Valor de 0.445).
      Propósito:
      Estimar la distribución del nicho ecológico de Ficus aurea en México
      Información suplementaria:
      Se utilizaron registros de presencia de la especie para desarrollar el modelo, así como las siguientes capas bioclimáticas de Worldclim: 1. Temperatura media anual (°C), 2. Variación media diurna (°C), 3. Isotermalidad, 4. Estacionalidad de la Temperatura (°C), 5. Maxima temperatura del mes más cálido (°C), 6. Minima temperatura del mes más frío (°C), 7. Variación anual de la temperatura (°C), 8.Media de la temperatura del cuarto mes más húmedo (°C), 10. Media de la temperatura del mes más cálido (°C), 11. Media de la temperatura del cuarto mes más frío (°C), 12. Precipitación anual (mm), 13. Precipitación del mes más húmedo (mm), 16. Precipitación del cuarto mes más húmedo (mm) y 19. Precipitación del cuarto mes más frío (mm). La región de referencia (M) se construyó con base en las provincias biogeográficas: Sierra Madre Orientalense, Neovolcanense, Nayaritense,Jalisqueno-Guerrerense,Oaxaquense, Pacifiquense, Campechano-Petenense, Chiapasense, Veracruzense, Sierra Madre Sureña (Ferrusquía-Villafranca, 1990). Del número de sitios utilizados para modelar, (1) se encuentran fuera del modelo Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos.cgi?Letras=JM&Numero=37
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1865-2010
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -111.250175476074, (Este) -86.7355804443359, (Norte) 31.4128742218018, (Sur) 14.5671091079712
    6. Palabras clave
      Tema:
      2013, Ficus aurea, JM037, Modelo de nicho ecológico
      Lugar:
      Aguascalientes, Altiplanense, Belize, Campechano-Petenense, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Colima, Chiapas, Chiapasense, Chihuahua, Distrito Federal, Durango, Estados Unidos de América, Guanajuato, Guerrero, Hidalgo, Jalisco, Jalisqueno-Guerrerense, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Nayarit, Nayaritense, Neovolcanense, Nuevo León, Oaxaca, Oaxaquense, Pacifiquense, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, República de Guatemala, República Mexicana, San Luis Potosí, Sierra Madre Occidentalense, Sierra Madre Orientalense, Sinaloa, Sinaloense, Sonora, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave, Veracruzense, Yucatán, Yucatanense, Zacatecas
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Magnoliopsida, Urticales, Moraceae, Ficus, Ficus aurea, aguacatillo, álamo, amate, higuerón
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012'

        20120000. Ibarra-Manriquez, G., G. Cornejo-Tenorio, N. González-Castañeda, E.M. Piedra-Malagón, A. Luna, (2012), 'El género Ficus L. (Moraceae) en México Ibarra-Marríquez et al., 2012', Botanical Sciences, 90(4): 389-452,

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Plantae: Magnoliophyta: Magnoliopsida: Urticales: Moraceae: Ficus: (, , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/fau037dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/fau037dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      R 2.15.1, ILWIS 3.4, QuantumGIS 1.7.4, Maxent 3.3.3e, ArcMap 10, Dell Vostro 470, Intel ® Core i7, 3.40GHz, RAM 4 GB, Windows 7
    16. Documentos relacionados

      Ficus aurea (aguacatillo) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Ficus aurea (aguacatillo) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (López-Toledo e Ibarra-Manríquez, 2015)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Ficus aurea a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 29824ANGIO en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se revisó la base de datos y se obtuvieron los registros de Ficus aurea, a los cuales se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012), es decir, si los registros se distribuye espacialmente al azar. Si los registros cumplen con esta prueba, estos son particionados en 75% para entrenar y 25% para validar el modelo. De lo contrario si los registros se distribuyen de forma agregada, se realiza un análisis de patrones utilizando Ilwis 3.4, para obtener la distancia en donde los registros ya no están auto correlacionados. A partir de la distancia obtenida en Ilwis, se hizo una cuadrícula en Quantum GIS 1.7.4, para hacer una selección aleatoria de un registro por celda, que sirvieron para entrenar el modelo; mientras que los registros no seleccionados se utilizó el 25% de ellos para validar el modelo. Para elaborar el dato geográfico de la distribución de la especie se utilizaron tanto los registros de la selección aleatoria como el 25% restantes de los registros, junto con las 20 variables ambientales; se metieron a Maxent 3.3.3 para general el modelo y el Sistema de Información Geográfica ArcMap 10 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. La región geográfica para la elaboración del modelo fueron las provincias bióticas (Ferrusquía-Villafranca 1990) en las que se ha colectado la especie y las provincias en las que es posible su presencia (Sierra Madre Occidentalense, Altiplanense y Sinaloense). Por último la validación del modelo generado se hizo con una prueba binomial, para verificar si este es mejor que uno al azar (p < 0.5)
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Ferrusquía-Villafranca, I., (1990), 'Provincias Bióticas (con énfasis en criterios morfotectónicos)', Escala 1:4000000. Universidad Nacional Autónoma de México, Instituto de Geografía, México, D. F. Regionalización Biogeográfica, IV.8.10. Atlas Nacional de México. Vol. II., http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/?vns=gis_root/region/fisica/rmorf4mgw

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas, las unidades y formato de los datos favor de revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/joc.1276/pdf, http://www.worldclim.org/

      • A. Luna-Nieves, Ibarra-Manríquez, G., L. López-Toledo, (2015), 'Distribución potencial del género Ficus (Moraceae) en México', versión: 1, Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo, Universidad Nacional Autónoma de México, México. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM037,

      Procedimientos:

      • No aplica: A los 207 registros (georreferenciados) de la especie, se les aplicó una prueba de aleatoriedad utilizando R (R Development Core Team, 2012), debido a que no paso esta prueba, es decir, que los registros se encuentran agregados; se realizó un análisis de patrones en Ilwis 3.7, para calcular la probabilidad de 1.0 de encontrar un registro a cierta distancia donde los registros ya no están autocorrelacionados; el valor de la distancia se empleó para formar una cuadrícula en Quantum GIS 1.7.4., el programa selecciona un registro al azar de cada celda de la cuadrícula (11 registros), que sirvieron para entrenar el modelo. De los registros no seleccionados (196 registros), se procesan en ArcMap para hacer una partición y sólo el 25% se empleó para validar el modelo (49 registros). Se emplearon 20 variables ambientales. Las variables y los registros de entrenamiento se utilizaron para modelar la distribución de la especie en el programa Maxent 3.3.3e. La configuración en Maxent fue por default (Phillips y Dudik, 2008), excepto la desactivación de 'Extrapolate' y 'Do clamping' (comunicación personal T. Peterson) y el formato de salida del modelo logístico. El modelo se transformó a una capa booleana (presencia-ausencia) para esto se tomó como umbral de corte el maximum training sensitivity plus specificity (Peterson et al., 2007) (Valor de 0.445). La validación del modelo se hizo con una prueba binomial para evaluar si este es mejor que al azar (p < 0.5). El número de éxitos se obtiene cuantificando cuantos registros de validación tienen valores logísticos por arriba del umbral de corte. ROC parcial AUC 0.33-1.1 , Prueba binomial <0.01 El número de sitios mencionados en la metodología no coincide con el número de sitios en la base de datos Darwin Core.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      2753
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: FAU037DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      fau037dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      04-10-2015
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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