Crotalus transversus (víbora-cascabel bandas cruzadas). Distribución potencial (Campos-Rodríguez et al., 2015)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Campos-Rodríguez, J. I., X. Flores-Leyva, A. Crispín-Flores, F. L. López-Galicia, M. del C. Díaz-Flores, (2015)

Palabras clave: 2015, Crotalus transversus, Distribución potencial, JM042, víbora-cascabel bandas cruzadas

Fecha de publicación: 07-09-2015, del metadato 07-09-2015

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  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Campos-Rodríguez, J. I., X. Flores-Leyva, A. Crispín-Flores, F. L. López-Galicia, M. del C. Díaz-Flores, (2015). 'Crotalus transversus (víbora-cascabel bandas cruzadas). Distribución potencial', escala: 1:1000000. edición: 1. Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional.. Proyecto: JM042, Modelaje de la distribución potencial de 10 especies de anfibios y reptiles en riesgo de extinción con escasos registros de presencia. El proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO).. México.
      Fecha de publicación:
      07-09-2015
      Nombre del producto:
      Crotalus transversus (víbora-cascabel bandas cruzadas). Distribución potencial (Campos-Rodríguez et al., 2015)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/metadatos/doc/html/ctr042dpgw.html
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo de distribución potencial de Crotalus transversus, se elaboró dentro del proyecto JM042 Modelaje de la distribución potencial de 10 especies de anfibios y reptiles en riesgo de extinción con escasos registros de presencia, apoyado por CONABIO. El objetivo fue estimar la distribución potencial de esta especie, utilizando como datos geográficos digitales los sitios de recolecta georreferenciados y 8 variables bioclimática más altitud de WorldClim a una resolución de 1 km cuadrado. Ambos conjuntos de datos fueron incorporados en el programa MaxEnt 3.3.3k para generar el modelo, que fue recortado bajo el umbral Minimum Training Presence y convertido a shapefile para definir el área de presencia
      Propósito:
      Estimar la distribución espacial de Crotalus transversus
      Información suplementaria:
      Se da un agradecimiento especial a los curadores de las colecciones: Colección Herpetológica, Museo de Zoología Alfonso L. Herrera, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México (MZFC); y Colección Nacional de Anfibios y Reptiles, Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México (CNAR), por proporcionar información empleada en el presente trabajo. Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=42
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1942-2011
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      Sierra Ajusco-Chichinautzin, Lagos y Volcanes de Anáhuac, Cerro de las Cruces, República Mexicana
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -100.620956420898, (Este) -98.562614440918, (Norte) 19.8388557434082, (Sur) 18.9388523101807
    6. Palabras clave
      Tema:
      2015, Crotalus transversus, Distribución potencial, JM042, víbora-cascabel bandas cruzadas
      Lugar:
      Distrito Federal, México, Michoacán de Ocampo, Morelos, Puebla, República Mexicana
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Reptilia, Squamata, Viperidae, Crotalus, Crotalus transversus, víbora-cascabel bandas cruzadas, cascabel cruz rayada de montaña, víbora de cascabel, cross-banded mountain rattlesnake
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Herpetofauna Mexicana: Lista anotada de las especies de anfibios y reptiles de México, cambios taxonómicos recientes, y nuevas especies'

        19930000. Flores-Villela, O., C. J. McCoy, (1993), 'Herpetofauna Mexicana: Lista anotada de las especies de anfibios y reptiles de México, cambios taxonómicos recientes, y nuevas especies', Carnegie Museum of Natural History, Pittsburgh, Pennsylvania, USA.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Reptilia: Squamata: Viperidae: Crotalus: (, , , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/ctr042dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/ctr042dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      Maxent 3.3.3k, DIVA-GIS 7.5, ArcView 3.2, Hewlett- Packard HP Pavilion Notebook PC, Intel ® Cote ™ i5-2430 M CPU 2.4 GHz RAM 4 GB, Windows 7 Home Basic © 2009 Microsoft Corporation 64 bits
    16. Documentos relacionados

      Crotalus transversus (víbora-cascabel bandas cruzadas). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Campos-Rodríguez et al., 2015)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Crotalus transversus (víbora-cascabel bandas cruzadas). Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Campos-Rodríguez et al., 2015)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Crotalus transversus a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 1010REPTI en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se revisó y depuro las bases de datos de los registros de la ubicación de Crotalus transversus proporcionados por el SNIB-CONABIO, Herpnet, GBIF y localidades reportadas en la literatura especializada (Amstrong y Murphy, 1979; Camarillo y Campbell, 1993, 2002; Campbell, 1982,1988; Campbell y Lamar, 2004; Centenero-Alcalá et al. 2010; Davis y Smith, 1953; García-Vázquez et al. 2008; Heimes y Cortés, 2004; Klauber, 1952, 1971, 1972; Martín del Campo, 1940; Taylor, 1944). Se obtuvieron los datos geográficos de las variables climáticas utilizadas como variables independientes mediante el programa DIVA GIS, las variables climáticas fueron obtenidas de WordClim (Hijmans et al. 2004). Se utilizó el programa MaxEnt 3.3.3k para generar los modelos y el Sistema de Información Geográfica ArcView 3.1 para realizar los distintos procesos en la elaboración del dato geográfico de distribución potencial de la especie. La region geográfica para la elaboración del modelo se definió como las subprovincias fisiográficas Mil Cumbres y Lagos y Volcanes del Anáhuac (INEGI, 2001). Está delimitada por las coordenadas extremas: -99.574735 oeste, -98.932574 este, 19.650968 norte y 19.004403 sur. Las variables independientes utilizadas para la generación del modelo fueron: altitud, isotermalidad, estacionalidad de la temperatura, temperatura máxima promedio del mes más cálido, temperatura mínima promedio del mes más frío, precipitación del mes más seco, estacionalidad de la precipitación, precipitación del trimestre más seco y precipitación del trimestre más frío. Se emplearon los estadísticos de evaluación D y P de Pearson et al., (2007) como métodos de evaluación global del modelo, dado que por el escaso número de registros de presencia no fue posible utilizar AUC parcial.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Campos-Rodríguez, J. I., X. Flores-Leyva, A. Crispin-Flores, F. L. López-Galicia, M. del C. Díaz-Flores, (2015), 'Modelaje de la distribución potencial de 10 especies de anfibios y reptiles en riesgo de extinción con escasos registros de presencia', versión: 1, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, Instituto Politécnico Nacional, México. Base de datos SNIB-CONABIO, proyecto No. JM042, http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=42

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:1000000. versión: 1.4, WorldClim, University of California, Berkeley. U.S.A.. Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas y las unidades y formato de los datos, revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology 25: 1965-1978, https://www.worldclim.org/

      • INEGI, (2001), 'Conjunto de datos vectoriales fisiográficos. Continuo Nacional serie I', Escala 1:1000000. Instituto Nacional de Estadística, Geografía e Informática, México.http://www.beta.inegi.org.mx/app/biblioteca/ficha.html?upc=702825267575.

      • Pearson, R. G., C. J. Raxworthy, M. Nakamura, A.T. Peterson, (2007), 'Predicting species distributions from small numbers of occurrence records: A test case using cryptic geckos in Madagascar', Journal of Biogeography, 34, 102-117 DOI: 10.1111/j.1365-2699.2006.01594.x, https://www.researchgate.net/publication/227714587_ORIGINAL_ARTICLE_Predicting_species_distributions_from_small_numbers_of_occurrence_records_a_test_case_using_cryptic_geckos_in_Madagascar

      Procedimientos:

      • No aplica: Se revisó y depuró las bases de datos de los registros disponibles de Crotalus transversus, para delinear la distribución geográfica conocida de la especie, la validez taxonómica de los registros disponibles y el número de registros de presencia únicos. Los registros de presencia fueron georreferenciados en cartas topográficas digitales 1:50,000 de INEGI empleando ArcMap 10.0, siguiendo el procedimiento de atomización descrito en el Manual de Procedimientos de Georreferenciación de Localidades de Colecciones Biológicas de la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO, 2008). Las coordenadas geográficas obtenidas mediante el proceso de georreferenciación fueron cotejadas con las coordenadas contenidas en la base de datos original consultada. Se corrigieron las incongruencias geográficas detectadas, verificando la validez de los datos geográficos originales con las cartas topográficas 1:50000 de INEGI. Los detalles específicos de las correcciones efectuadas a las bases de datos originales se describen en el informe del proyecto. Después se elaboró un dato geográfico de la distribución de la especie en formato shapefile, representado por puntos. Posteriormente, se generaron los datos geográficos de 19 variables climáticas utilizando los datos de temperatura, precipitación y altitud de WordClim (Hijmans et al. 2004). Para seleccionar las variables bioclimáticas se inició formado subconjuntos de acuerdo con los siguientes criterios: 1) Variables identificadas en un análisis de Jakknife como las de mayor contribución a un modelo experimental corrido con MAXENT 3.3.3k de C. transversus, considerando las 19 variables climáticas de WordClim (Hijmans et al. 2004) más la altitud; 2) variables bioclimáticas no correlacionadas entre sí, de acuerdo con un análisis de componentes principales (ACP) efectuado en el programa PAST 2.09 cuya matriz fue de correlación y 3) Aquellas variables bioclimáticas con mayor contribución al Componente Principal 1 de acuerdo con el mencionado ACP. Se efectuaron seis combinaciones de variables bioclimáticas (ver descripción en el informe final del proyecto) cuyos modelos experimentales fueron corridos en MAXENT 3.3.3k, los modelos promedio (averange) resultantes fueron inspeccionados a efecto de seleccionar aquella combinación de variables que producían modelos aceptables, es decir que no tuvieran errores de omisión o comisión notorios en relación a las localidades de presencia conocidas y la distribución conocida o inferida. Mediante el proceso mencionado, fueron seleccionadas ocho variables bioclimáticas más la altitud, las cuales fueron: BIO3 (Isotermalidad °C), BIO4 (Estacionalidad de la temperatura °C), BIO5 (Temperatura máxima promedio del mes más cálido °C),BIO6 (Temperatura mínima promedio del mes más frío), BIO14 (Precipitación del mes más seco mm), BIO15 (Estacionalidad de la precipitación mm), BIO17 (Precipitación del trimestre más seco mm), BIO19 (Precipitación del trimestre más frío mm) y Altitud (msnm). Esta combinación de variables fue seleccionada, debido a que el modelo promedio resultante incluía a la mayoría de las localidades de presencia conocidas de la especie. El resto de combinaciones de variables generaron modelos que tendían a cometer errores de comisión, al sobre predecir la presencia de la especie en sitios donde definitivamente no se ha registrado a la misma o bien presentaban errores de omisión donde se excluían una o varias localidades de presencia confirmadas para la especie. Los modelos exploratorios corridos en MAXENT 3.3.3k sugirieron que el nicho fundamental de C. transversus se localiza dentro de la provincia biótica Faja Volcánica Transmexicana, particularmente dentro de las subprovincias fisiográficas Lagos y Volcanes del Anáhuac y Mil Cumbres (INEGI, 2001). Considerando que C. transversus es una especie endémica de distribución sumamente restringida (Campbell y Lamar, 2004), se disminuyó en un principio la Región de Accesibilidad M a la provincia fisiográfica Lagos y Volcanes del Anáhuac, dado que en ella se encuentran todos los registros plenamente confirmados de la especie. No obstante, se advirtió que cuando M se restringía únicamente a Lagos y Volcanes de Anáhuac, el modelo de C. transversus tendía a marcar la Sierra de las Cruces como un área de probabilidad media a buena, lo anterior no es congruente con la información disponible sobre distribución de la especie, dado que en la Sierra de las Cruces se ha confirmado plenamente la presencia de la especie y a que esta serranía aparentemente forma un corredor continuo con la Sierra Ajusco-Chichinautzin (Rzedoswky y Rzedoswky, 1991; Camarillo y Campbell, 2002; Campbell y Lamar 2004) por lo que se esperaría que las zonas de presencia óptima de la especie se localizaran también en la Sierra de las Cruces. En cambio, cuando M abarcaba también la provincia Mil Cumbres el modelo tendía a manifestar un mejor desempeño al mejorar la probabilidad de presencia en la Sierra de las Cruces. Por tanto, la M seleccionada para C. transversus fueron las provincias Lagos y Volcanes del Anáhuac y Mil Cumbres (INEGI, 2001). Para la construcción del modelo, se utilizaron 11 datos de presencia de la especie en formato .CSV y ocho capas bioclimáticas más la altitud en formato ASCII, que fueron ingresadas al programa MAXENT 3.3.3k. Los parámetros de elaboración fueron: features, linear (L) y quadratic (Q); output format, Logistic; output file type, grd; replicates, 11; replicated run type, Crossvalidate; remove duplicate presence records, si; do clamping, no; otros parámetros por default. Debido al tamaño de muestra pequeño, cada localidad influye fuertemente sobre la proyección, por lo que se seleccionó el modelo promedio (average). El modelo seleccionado en formato GRD, fue recortado en el programa DIVA-GIS 7.5 bajo el umbral Minimum training presence logistic threshold con valor de 0.4294. El archivo resultante fue tratado con el programa ArcView 3.2, utilizando la herramienta Convert to Grid del menú Theme, posteriormente 'los tres archivos generados se exportaron al programa ArcMap 10, donde se seleccionó uno de los archivos y empleando la herramienta Raster to Polygon (con opción Simplify polygons desactivada), del menú Conversión Tools, se convirtió a formato vectorial. Para evaluar el desempeño de los modelos obtenidos se empleó el programa p-value-compute.exe elaborado por Pearson et al. (2007), el cual calcula el valor de p a partir del estadístico D, mediante la suma de las probabilidades para cada caso existente.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      27
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: CTR042DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      VALUE Numérico Datos del proyecto Espacio geográfico convencional ocupado por la especie: 1=área ocupada (zona que cuenta con condiciones ambientales y bióticas favorables y que ha estado accesible a la especie y 0=área invadible (zona con condiciones ambientales y bióticas favorables, pero no accesible a la especie). -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      ctr042dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener sistemas compatibles con archivos Shapefile, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      07-09-2015
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subdirección de Gestión de Sistemas Geoespaciales

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, Ciudad de México, 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 01 55 5004 4931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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