Oryzomys chapmani (ratón de Chapman) Distribución potencial (Lavariega y Briones-Salas, 2019)

Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

Autor: Lavariega, M. C., M. Briones-Salas, (2019)

Palabras clave: 2019, Distribución potencial, JM011, Mamíferos, Oryzomys chapmani, ratón

Fecha de publicación: 20-03-2019, del metadato 20-03-2019

Descargas: Google Earth (KML), ESRI Shapefile (SHP), Metadatos

Accesos directos: Vista previa, Geoportal CONABIO, Metadato (HTML).

Temas relacionados: Este documento contiene referencias a una colección de 3 temas. Consulte la sección 1.16 para ver más detalles.

1002 x 774 píxeles

imprimir

Metadato completo [-]

  1. Información de identificación
    1. Referencia
      Información de referencia:
      Autor:
      Lavariega, M. C., M. Briones-Salas, (2019). 'Oryzomys chapmani (ratón de Chapman). Distribución potencial.', escala: 1:1000000. edición: 1. Centro Interdisciplinario de Investigación para el Desarrollo Integral Regional Unidad Oaxaca. Proyecto: JM011, Modelado de la distribución geográfica de mamíferos endémicos y en categoria de riesgo de Oaxaca. El Proyecto fue financiado por la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO). Xoxocotlán, Oaxaca.
      Fecha de publicación:
      20-03-2019
      Nombre del producto:
      Oryzomys chapmani (ratón de Chapman) Distribución potencial (Lavariega y Briones-Salas, 2019)
      Formato de representación geográfica:
      Shapefile. Formato vectorial compuesto por 4 archivos (shp, shx, dbf,prj)
      Información complementaria:
      Escala: 1:1000000
      Acceso en línea:
      http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/och011dpgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
    2. Descripción
      Resumen:
      El modelo muestra la distribución potencial Oryzomys chapmani (ratón), que es considerada una especie sin riesgo por la legislación mexicana y de menor riesgo por la IUCN. Su distribución geográfica comprende la Sierra Madre Oriental y Sierra Madre Occidental, Sierra Madre del Sur de México, hasta Guatemala.
      Propósito:
      Mostrar la distribución potencial de Oryzomys chapmani.
      Información suplementaria:
      Referencias en la web: http://www.conabio.gob.mx/institucion/cgi-bin/datos2.cgi?Letras=JM&Numero=11
    3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
      No aplica
      Vigencia:
      1940-2005
    4. Estado de la información
      Progreso:
      Terminado
      Mantenimiento:
      No planeado
    5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
      México y Centroamérica
      Coordenadas extremas:
      (Oeste) -101.161354064941, (Este) -85.5280151367188, (Norte) 26.2631435394287, (Sur) 12.6631488800049
    6. Palabras clave
      Tema:
      2019, Distribución potencial, JM011, Mamíferos, Oryzomys chapmani, ratón
      Lugar:
      Belice, Campeche, Coahuila de Zaragoza, Chiapas, El Salvador, Estado de México, Guanajuato, Guatemala, Hidalgo, Honduras, México, Morelos, Nicaragua, Nuevo León, Oaxaca, Puebla, Querétaro de Arteaga, Quintana Roo, San Luis Potosí, Tabasco, Tamaulipas, Tlaxcala, Veracruz de Ignacio de la Llave
    7. Taxonomía
      Palabras clave:
      Tema: Mammalia, Rodentia, Muridae, Oryzomys, Oryzomys chapmani, ratón de Chapman, rata arrocera de Chapman, chapman's rice rat
      Sistema taxonómico:

      Clasificación:

      Fuente:

      • 'Mammal Species of the World, 3rd edition'

        20050000. Wilson, D. E., Reeder, D. M., (2005), 'Mammal Species of the World, 3rd edition', Johns Hopkins University Press, Maryland, Estados Unidos.

      Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

      Animalia: Chordata: Mammalia: Rodentia: Muridae: Oryzomys: (, , )

    8. Herramienta de análisis
    9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
    10. Condiciones de uso

      Importante:

    11. Contacto
    12. Vista previa
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/20/och011dpgw
      Descripción:
      171 x 132 píxeles
      Formato:
      image/png
      Nombre del recurso:
      http://geoportal.conabio.gob.mx/descargas/mapas/imagen/96/och011dpgw
      Descripción:
      1002 x 774 píxeles
      Formato:
      image/png
    13. Créditos y reconocimientos
    14. Restricciones de uso
    15. Sistema nativo
      MaxEnt 3.3.3a, ArcInfo 9.3, Toshiba Satellite L635, Intel® Core i5, 2.53GHz, RAM 4.00Gb, Windows 7 Home Premium, 64 bits
    16. Documentos relacionados

      Oryzomys chapmani (ratón de Chapman) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Lavariega y Briones-Salas, 2019)

      Archivo de descarga compactado en ZIP. Contiene ESRI Shapefile (SHP) en Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326).

      Oryzomys chapmani (ratón de Chapman) Registros de presencia usados para elaborar el mapa de distribución potencial (Lavariega y Briones-Salas, 2019)

      Acceso directo al mapa en el Geoportal de CONABIO. Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Página de enciclovida para Oryzomys chapmani a nivel de especie

      Enlace por idcatalogo 11372MAMIF en http://enciclovida.mx/especies/

  2. Calidad de la información
    1. Precisión de los atributos no espaciales
    2. Consistencia lógica
      Gabinete
    3. Cobertura del tema
      Se obtuvieron registros de presencia de Oryzomys chapmani de colecciones científicas nacionales e internacionales y de literatura científica. Estos registros fueron georreferenciados usando gaceteros y mapas vectoriales. Por otra parte, se obtuvieron variables bioclimáticas de wordlclim.org en formato ASCII y una resolución cercana a 1 km. Para la elaboración del modelo se seleccionaron las provincias fisiográficas Sierra Madre Oriental, Eje Neovolcánico Transversal, Golfo de México, Chiapas y Oriente de América Central (Morrone, 2001), que corresponden al área accesible de distribución geográfica de de la especie. Los polígonos de las provincias fisiográficas se crearon a partir de archivos shapefile de las Ecorregiones de América de la World Wildlife Fund. Las variables utilizadas se seleccionaron con base en la información que aportaron a modelos de prueba, la correlación entre ellas y su importancia en la biología de la especie. Los registros de presencia se dividieron en registros de entrenamiento y en registros de evaluación externa. Las variables bioclimáticas y los registros de entrenamiento se incorporaron al programa MaxEnt 3.3.3.a para generar los modelos. El mejor modelo se importó al Sistema de Información Geográfica (SIG) ArcInfo 9.3, en donde fue reclasificado a un mapa binario de presencia/ausencia. La evaluación del modelo se realizó con el área bajo la curva ROC.
    4. Precisión de los atributos espaciales
    5. Procesamiento

      Fuentes:

      • Briones-Salas, M., M. C. Lavariega, Y. Martínez-Ayón, N. Martín-Regalado, Y. Santiago-Matías, (2019), 'Modelado de la distribución geográfica de mamíferos endémicos y en categoria de riesgo de Oaxaca', Escala 1:1. versión: 1, Colección Regional de Mamíferos del CIIDIR-Oaxaca, Oaxaca de Juárez, Oaxaca. Bases de datos SNIB-CONABIO proyecto No. JM011,

      • Hijmans, R. J., S. E. Cameron, J. L. Parra, P. G. Jones, A. Jarvis, (2005), 'Global Climate Data', Escala 1:100000. versión: 1.4, WorldClim, Para información de los métodos usados para generar las capas climáticas y las unidades y formato de los datos revisar el siguiente artículo: Hijmans, R.J., S.E. Cameron, J.L. Parra, P.G. Jones and A. Jarvis, 2005. Very high resolution interpolated climat, www.worldclim.org.

      • IUCN, (2012/06/20), 'IUCN Red List of Threatened Species. Versión 2012.1', versión: 1, International Union for the Conservation of Nature, Suiza. Historia natural de la especie, estatus de conservación, http://www.iucnredlist.org/

      • Juan J. Morrone, (2001), 'Biogeográfia de América Latina y el Caribe', Zaragoza, España. M&T- Manuales & Tesis SEA, vol 3,

      • Olson, D. M., E. Dinerstein, E. D. Wikramanayake, N. D. Burgess, G. V. N. Powell, E. C. Underwood, J. A. D'Amico, I. Itoua, H. E. Strand, J. C. Morrison, C. J. Loucks, T. F. Allnutt, T. H. Ricketts, Y. Kura, J. F. Lamoreux, W. W. Wettengel, P. Hedao, K. R. Kassem, (2001), 'Terrestrial Ecoregions of the World (TEOW)', World Wildlife Fund, La información sobre los métodos usados para generar las capas de Ecorregiones Terrestres del Mundo se pueden consultar en: Olson, D. M., Dinerstein, E., Wikramanayake, E. D., Burgess, N. D., Powell, G. V. N., Underwood, E. C., D'Amico, J. A., Itoua, I., http://worldwildlife.org/publications/terrestrial-ecoregions-of-the-world

      Procedimientos:

      • No aplica: Las localidades de recolecta de Oryzomys chapmani fueron georreferenciadas con la ayuda de mapas vectoriales escala 1:250,000 y GoogleEarth©. En el SIG ArcInfo 9.3 se importaron los registros de recolecta de la especie y se generó un dato geográfico en formato shapefile representado por puntos. Se consultó literatura de la especie para delimitar el área accesible (Barve et al., 2011) y para identificar a las variables bioclimáticas que restringen su presencia. Las variables utilizadas para la creación del modelo fueron: Altitud, Rango de temperatura diurna, Isotermalidad, Estacionalidad en la temperatura, Temperatura máxima del mes más cálido, Temperatura mínima del mes más frío, Rango anual de temperatura, Precipitación anual, Precipitación del mes más seco, Estacionalidad en la precipitación, Precipitación del trimestre más cálido y Precipitación del trimestre más frío. Para generar el modelo, los datos geográficos de la especie y las variables bioclimáticas se incorporaron al programa MaxEnt 3.3.3a. De un total de 65 registros únicos y confiables de presencia de la especie a lo largo de su distribución global, se utilizó el 71% para calibración y el resto para una evaluación externa. Los parámetros para la generación del modelo fueron: características automáticas, formato de salida logístico, formato del archivo de salida ASCII, regularización de 1, 1 réplica y 10,000 puntos máximos de background. El modelo fue importado a ArcInfo 9.3, convertido a formato GRID y multiplicado por 100. Para la evaluación, se sobrepusieron los registros de evaluación externa sobre el modelo y se extrajeron los valores con la herramienta Extract Values to Points; estos valores y las frecuencias de los valores del modelo se exportaron, en formato csv, al programa setupROCWOG (Narayani, 2008). El proceso de evaluación arrojó un AUC de . Finalmente, el modelo se reclasificó a un mapa de presencia/ausencia tomando como umbral el valor de Fixed cumulative value 5 (0.038). Para modelar la especie, también se usaron los registros de la subespecies Oryzomys chapmani chapmani, Oryzomys chapmani dilutior.

    6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
  3. Atributos espaciales
    1. Representacion espacial
    2. Método de representacion espacial
      Vector
    3. Información de vectores y puntos
      Descripción SDTS (Spatial Data Transfer Standard - Spatial Data Concepts):
      Tipo de objetos punto y vectores:
      G-polygon
      Número de puntos o vectores:
      6363
    4. Información de imágenes
  4. Sistema de referencia
    1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
      Resolución de la latitud:
      0.0174532925199433
      Resolución de la longitud:
      0.0174532925199433
      Unidades de las coordenadas Geográficas:
      Decimal degrees
      Modelo geodésico:
      Datum horizontal:
      WGS84
      Elipsoide:
      WGS84
      Semieje mayor:
      6378137.000000
      Denominador del factor de achatamiento:
      298.257224
    2. Sistema de coordenadas (vertical)
  5. Atributos no espaciales
    1. Descripción detallada

      Nombre: OCH011DPGW.DBF

      Definición: La tabla contiene valores de 0 equivalente a ausencia y 1 a presencia de la especie.

      Fuente: No conocido

      Atributo Descripción Fuente [1] Dominio [2] Precisión [3]
      GRIDCODE Numérico Datos del proyecto. Indica como 1 valores de presencia de la especie y como 0 valores de ausencia. -
    2. Descripción resumida
  6. Distribución de la información
    1. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    2. Nombre de referencia
      och011dpgw
    3. Responsabilidad
      La Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
    4. Medios de distribución

      Digitales:

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

    5. Medios de distribución especiales
    6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info, Arcview o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
    7. Disponibilidad
  7. Acerca de este documento
    1. Fecha de creación o última actualización
      20-03-2019
    2. Fecha de última revisión
    3. Fecha de la siguiente revisión
    4. Información de contacto

      Subcoordinación de Sistemas de Información Geográfica

      ssig@conabio.gob.mx

      Administrador de Metadatos


      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 5012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

    5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
    6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
    7. Uso horario
    8. Condiciones de acceso
    9. Condiciones de uso
    10. Restricciones de seguridad o privacidad
    11. Extensiones
COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

A menos que se indique lo contrario la información disponible en esta página se distribuye bajo una licencia Creative Commons Atribución 4.0 Internacional. (compatible con los términos de libre uso MX de datos.gob.mx.)