## Sus scrofa Distribución potencial actual en México (Martínez et al. 2016) #### Catálogo de metadatos geográficos. Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad Autor: E. Martínez-Meyer, A. Cuervo-Robayo, G. A. Ortíz-Haro, L. A. Osorio-Olvera, (05/09/2016). 'Distribución potencial actual de Sus scrofa en México', escala: 1:4000000. edición: 1. Instituto de Biología, UNAM. Proyecto: 00089333, Extraído del proyecto 00089333: 'Aumentar las Capacidades Nacionales para el Manejo de las Especies Exóticas Invasoras (EEI) a través de la Implementación de la Estrategia Nacional de EEI', como un servicio de consultoría para la modelación de la distribución potencial actual y futura de las especies invasoras de mayor riesgo para México. Este proyecto se desarrolló con financiamiento del Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD) y en colaboración con la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Bidiversidad (CONABIO).. Ciudad de México, México. Palabras clave: aspecto, biótico, distribución, potencial, especies, invasoras, sus, scrofa Fecha de publicación: 05-09-2016, del metadato 05-09-2016 Datos: TIF, KML, WMS, Geoportal CONABIO. Metadatos: XML, HTML |

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1. Información de identificación
   1. Referencia
      Información de referencia:
        Autor:
          E. Martínez-Meyer, A. Cuervo-Robayo, G. A. Ortíz-Haro, L. A. Osorio-Olvera, (05/09/2016). 'Distribución potencial actual de Sus scrofa en México', escala: 1:4000000. edición: 1. Instituto de Biología, UNAM. Proyecto: 00089333, Extraído del proyecto 00089333: 'Aumentar las Capacidades Nacionales para el Manejo de las Especies Exóticas Invasoras (EEI) a través de la Implementación de la Estrategia Nacional de EEI', como un servicio de consultoría para la modelación de la distribución potencial actual y futura de las especies invasoras de mayor riesgo para México. Este proyecto se desarrolló con financiamiento del Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo (PNUD) y en colaboración con la Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Bidiversidad (CONABIO).. Ciudad de México, México.
        Fecha de publicación:
          05-09-2016
        Nombre del producto:
          Sus scrofa Distribución potencial actual en México (Martínez et al. 2016)
        Formato de representación geográfica:
          GEOTIFF. Formato raster Resolución(990,990) metros
        Información complementaria:
          Escala: 1:4000000
        Acceso en línea:
          http://www.conabio.gob.mx/informacion/metadata/gis/ssc_presentgw.xml?_httpcache=yes&_xsl=/db/metadata/xsl/fgdc_html.xsl&_indent=no
   2. Descripción
      Resumen:
        En este estudio se modeló la distribución potencial actual y futura en México de 60 especies reconocidas en el mundo como de alta invasividad con el fin de identificar las zonas más susceptibles a la invasión en el país. Para ello se siguió el método de la distancia al centroide y la construcción de un elipsoide multidimensional de volúmen mínimo que representa el nicho ecológico de la especie con base en los registros mundiales. El nicho de cada especie fue proyectado a escenarios climáticos de alta resolución (1 km) en México para el presente y bajo dos escenarios futuros de emisiones, uno conservador (RCP 4.5) y uno drástico (RCP 8.5) y para dos períodos temporales, uno cercano (2050) y otro lejano (2070). Los escenarios climáticos futuros fueron construidos promediando las salidas de los modelos de nicho bajo los modelos generales de circulación: MPI-ESM-LR, GFDL-CM3, HADGEM2-ES y CNRM.
      Propósito:
        En este trabajo desarrollamos un esquema de modelación que permita obtener mapas de la distribución potencial actual y bajo diferentes escenarios de cambio climático en México para 60 especies identificadas de alto riesgo de invasión.
   3. Periodo de validez de los datos
      Fecha y hora:
        [Fecha no disponible]
      Vigencia:
        junio-noviembre de 2016
   4. Estado de la información
      Progreso:
        Terminado
      Mantenimiento:
        No planeado
   5. Dominio espacial
      Descripción de la extención geográfica:
        República Mexicana
      Coordenadas extremas:
        (Oeste) -117.5, (Este) -86.708331727, (Norte) 32.7173393079177, (Sur) 14.5340050259999
   6. Palabras clave
      Tema (CNB.CLASES.PROYECTO):
        Grupo temático, 00089333
      Tema (CONABIO):
        Aspecto biótico, Distribución potencial, Especies invasoras, Sus scrofa
      Localización (CONABIO):
        República Mexicana
   7. Taxonomía
      Palabras clave:
        Tema (taxon_conabio): Mammalia, Artiodactyla, Suidae, Sus, Scrofa
      Sistema taxonómico:

        Clasificación:

        Fuente:

        - ' NODC Taxonomic Code, database (version 8.0)'

          19960000. Gardner, AL, (1996), ' NODC Taxonomic Code, database (version 8.0)', 8, National Museum of Natural History, Washington, EU.

        Procedimiento taxonómico: No conocido

      Clasificación:

        Animalia: Chordata: Mammalia: Artiodactyla: Suidae: Sus: Scrofa

   8. Herramienta de análisis
   9. Condiciones de acceso
      Sin restricciones
   10. Condiciones de uso
       No se permite utilizar estos datos con fines lucrativos y se debe citar la fuente del mapa y a CONABIO. Ver la licencia completa en http://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/mx/
   11. Contacto
   12. Vista previa
       Nombre del recurso:
         http://www.conabio.gob.mx/informacion/gis/layouts/ssc_presentgw.png
       Descripción:
         Mapa ilustrativo de Sus scrofa Distribución potencial actual en México (Martínez et al. 2016). La proyección citada, es exclusiva para el diseño de esta imagen.
       Formato:
         png
   13. Créditos y reconocimientos
   14. Restricciones de uso
   15. Sistema nativo
       Dell Precision T1700 RAM 8.0. ArcGis 10.2., Windows
   16. Documentos relacionados
2. Calidad de la información
   1. Precisión de los atributos no espaciales
   2. Consistencia lógica
      Gabinete
   3. Cobertura del tema
      El análisis comprendió dos fases: (1) La conformación de las bases de datos de las especies invasoras, que implicó: (a) la selección de las especies a analizar, (b) la recopilación de datos de presencia de las especies seleccionadas y (c) la verificación y limpieza de las bases de datos. (2) El modelado de la distribución potencial actual y futura en México de las especies, con base en el método de la distancia al centroide del nicho ecológico (Martínez-Meyer et al. 2013).
   4. Precisión de los atributos espaciales
   5. Procesamiento

      Fuentes:

      - E. Martínez-Meyer, A. Cuervo-Robayo, G. A. Ortíz-Haro, L. A. Osorio-Olvera, (2016/09/05), 'Base de datos de los registros de presencia de Sus scrofa', Escala 1:4000000. 1, Instituto de Biología, UNAM, Ciudad de México, México.

      Procedimientos:

      - [Fecha no disponible]: 1. Conformación de las base de datos de las especies invasoras. La CONABIO ha identificado y priorizado a las especies invasoras con base en su nivel de daño causado. Para el caso de las 60 especies que se modelaron en esta consultoría, se consideraron los siguientes criterios: (1) que fueran terrestres, ya que no existen escenarios climáticos al futuro para los mares mexicanos; (2) que representaran un riesgo para una porción importante del país y no sólo para algunos sitios específicos, como algunas islas; y (3) que existan por lo menos 100 registros únicos de presencia de la especie en su área nativa de distribución y en sitios en donde ya se ha demostrado que es una especie invasora. Para hacer la selección de las 60 especies se tomaron de la lista de las especies más peligrosas identificadas por Conabio en orden decreciente con base en su puntaje de invasividad y al cumplimiento de los criterios mencionados. Para cada especie se consultaron diferentes repositorios y se descargaron las bases de datos de registros de presencia correspondientes. Para esto se utilizó la librería Spocc (Chamberlain et al. 2016) del programa R Core Team (2015), la cual permite acceder a diferentes repositorios en línea, incluyendo: Global Biodiversity Informatics Facility (GBIF), Bekerly Ecogine, iNaturalist, VertNet, Biodiversity Information Serving Our Nation (BISON), eBird, AntWeb. En el caso del Sistema de Información de la Biodiversidad (SNIB) de México, se utilizó el programa sqlite3. Los registros duplicados fueron eliminados en R utilizando la librería NicheToolBox (Osorio-Olvera 2016). 2. Modelación de la distribución potencial actual y futura . Los modelos de distribución potencial se produjeron con base en la reconstrucción del nicho ecológico de las especies (Peterson et al. 2011) bajo el método de distancia al centroide del nicho (Yañez-Arenas et al. 2012; Martínez-Meyer et al. 2013) a través de la construcción de un elipsoide de volumen mínimo (Qiao et al. 2016). El mapa resultante de esta modelación presenta valores de 0 a 1, que representan un índice de favorabilidad ambiental que para algunas especies se ha encontrado una asociación con la abundancia (Martínez-Meyer et al. 2013); es decir, los valores cercanos a 1 representan zonas con mejores condiciones ambientales para el establecimiento de una especie en donde sus abundancias podrían ser altas, mientras que los valores cercanos a 0 son condiciones ambientales favorables pero marginales, en donde se esperarían abundancias bajas. El procedimiento que se siguió para la modelación de la distribución potencial bajo el método de distancias al centroide fue el siguiente: (a) Los registros de cada una de las especies, tanto de su distribución nativa como de sus áreas de invasión, fueron divididos aleatoriamente en dos conjuntos, uno de calibración y otro de validación en una proporción de 70:30. En el caso en el que la especie estuviera presente actualmente en México, y que se tuvieran registros de presencia en el país, se utilizaron estos puntos para hacer la validación de los modelos. (b) Los datos de calibración fueron usados con la base de datos WorldClim (Hijmans et al. 2005) para extraer los valores de las variables climáticas para cada registro. WorldClim tiene una cobertura temporal de 1961-1990 y los análisis se hicieron a una resolución espacial de 10 minutos (aprox. 18.5 km). Se usó el sistema de modelación MaxEnt para identificar las tres variables ambientales más importantes para cada especie mediante el método de permutación (Phillips & Dudík 2008), que para esta especie fueron la Bio4, Bio5 y Bio12. (c) Con esa información se construyó un elipsoide multidimensional de volumen mínimo (Qiao et al. 2016) cuyo centroide es la media de las tres variables, y sus dimensiones fueron calculadas a partir de la matriz de covarianza de los datos. Este elipsoide representa, en efecto, el nicho ecológico (climático) de la especie. (d) Este nicho fue proyectado al espacio geográfico para obtener un mapa de distribución potencial mundial que fue evaluado con los registros de validación usando la prueba de Roc-parcial (Peterson et al. 2008). Para esta especie se obtuvo una proporción media de área bajo la curva (AUC ratio) = 1.36 y un P-valor = 0.042. € El elipsoide obtenido a partir de los registros mundiales representa los límites de tolerancia climática de la especie, es decir, una aproximación a su nicho ecológico fundamental. Para conocer el potencial invasivo actual y futuro de esas especies en México, el elipsoide fue proyectado a un escenario climático actual para el país (1961- 1990; a una resolución de 1 km) y posteriormente a escenarios climáticos futuros, uno cercano con su centro en 2050 (2041-2060) y otro lejano centrado en 2070 (2061-2080), bajo dos escenarios de concentraciones de gases de efecto invernadero en la atmósfera, uno conservador (RCP 4.5) y otro extremo (RCP 8.5). Los escenarios futuros se obtuvieron promediando las salidas de los modelos de nicho indivduales bajo los cuatro escenarios que de acuerdo con el CCAUNAM-INECC son los que mejor representan las tendencias climáticas históricas del país: MPI-ESM-LR (Alemania), GFDL-CM3 (Estados Unidos), HADGEM2-ES (Reino Unido) y CNRM (Francia) (Fernández Eguiarte et al. 2015). Referencias Chamberlain, S. Ram, K. & Hart T. 2016. spocc: R interface to many species occurrence data sources. R package version 0.5.0. https://github.com/ropensci/spocc. Fernández Eguiarte, A., Zavala Hidalgo, J., Romero Centeno, R., Conde Álvarez, A. C. & Trejo Vázquez, R. I. 2015. Actualización de los escenarios de cambio climático para estudios de impactos, vulnerabilidad y adaptación. Centro de Ciencias de la Atmósfera, Universidad Nacional Autónoma de México. Instituto Nacional de Ecología y Cambio Climático, Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales. Obtenido de: http://atlasclimatico.unam.mx/AECC/servmapas/. Hijmans, R. J., Cameron, S. E., Parra, J. L., Jones, P. G. & Jarvis, A. 2005. Very high resolution interpolated climate surfaces for global land areas. International Journal of Climatology. 25 (15): 1965-1978. Martínez-Meyer, E., Díaz-Porras, D. F., Peterson, A. T. & Yañez-Arenas, C. 2013. Ecological niche structure and rangewide abundance patterns of species. Biology Letters. 9 (1): 20120637. Osorio-Olvera, L. 2016. NicheToolBox R package. Https://github.com/luismurao/nichetoolbox. Peterson, A. T., Papes, M. & Soberón, J. 2008. Rethinking receiver operating characteristic analysis applications in ecological niche modeling. Ecological Modelling. 213 (1): 63-72. Peterson, A.T., Soberón, J., Pearson, R. G., Anderson, R. P., Martínez Meyer, E., Nakamura, M. & Araújo, M. B. 2011. Ecological Niches and Geographic Distributions. Monographs in Population Biology. Princeton University Press, Princeton, N.J. 314 p. ISBN: 978-1-4008-4067-0. Phillips, S. J. & Dudík, M. 2008. Modeling of species distributions with Maxent: new extensions and a comprehensive evaluation. Ecography. 31 (2): 161-175. Qiao, H., Escobar, L. E., Saupe, E. E., Ji & L. & Soberón, J. 2016. A cautionary note on the use of hypervolume kernel density estimators in ecological niche modelling. Global Ecology & Biogeography. Early view. Doi:10.1111/geb.12492. R Development Core Team. 2015. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. ISBN 3-900051-07-0. URL http://www.R-project.org. Yañez-Arenas, C, Martínez-Meyer, E., Mandujano, S. & Rojas-Soto, O. 2012. Modelling geographic patterns of population density of the white-tailed deer in central Mexico by implementing ecological niche theory. Oikos. 121 (12): 2081-2089.

   6. Porcentaje del área de estudio cubierta por nubes
3. Atributos espaciales
   1. Representacion espacial
   2. Método de representacion espacial
      Raster
   3. Información de vectores y puntos
   4. Información de imágenes
      Tipo de objeto:
        Pixel
      Dimensiones:
        Número de filas:
          2182
        Número de columnas:
          3695
        Número de niveles, capas, etc.. Vertical:
          1
4. Sistema de referencia
   1. Sistema de coordenadas (horizontal)
      Geográficas:
        Resolución de la latitud:
          0.0174532925199433
        Resolución de la longitud:
          0.0174532925199433
        Unidades de las coordenadas Geográficas:
          Decimal degrees
      Modelo geodésico:
        Datum horizontal:
          WGS84
        Elipsoide:
          WGS84
        Semieje mayor:
          6378137.000000
        Denominador del factor de achatamiento:
          298.257224
   2. Sistema de coordenadas (vertical)
5. Atributos no espaciales
   1. Descripción detallada

      Nombre: SSC_PRESENTGW.TIF

      Definición: Distribución potencial actual en México con valores de idoneidad climática de Sus scrofa

      Fuente: No conocido

      Atributo | Descripción | Fuente [1] | Dominio [2] | Precisión [3]
      Value | Numérico | Atributo por definición del mapa | Idoneidad climática para Sus scrofa en México | 1 (Valor relativo de idoneidad (0-1))

   2. Descripción resumida
6. Distribución de la información
   1. Información de contacto

      Jose Manuel Davila Rosas

      jdavila@conabio.gob.mx

      Subcoordinador de Sistemas de Información Geográfica

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 50045012 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   2. Nombre de referencia
      ssc_presentgw
   3. Responsabilidad
      La Subdirección de Sistemas de Información Geográfica de la CONABIO solo se hace responsable de la información presentada en el mapa y se deslinda del uso que se le de a la misma.
   4. Medios de distribución

      Digitales:

      - GeoTIFF (TIF), compactado en ZIP, 30.76 MB

        Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Formato raster GeoTIFF.

      - Google Earth (KML), compactado como KMZ

        Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Los archivos KML representan datos geográficos para Google Earth, a menudo suelen distribuirse comprimidos como KMZ.

      - Servicio de imágenes (WMS)

        Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326). Servicio Web Map Service. Los mapas de datos referenciados espacialmente producidos se generan normalmente en un formato de imagen como PNG, GIF o JPEG, pueden se vistos en un SIG

      - Mapa digital interactivo

        Coordenadas geográficas WGS84. (EPSG:4326)

      Precio: Acceso libre sin ningún cargo al público en general.

   5. Medios de distribución especiales
   6. Requisitos técnicos
      Tener Arc-Info o sistemas compatibles, en caso que existan se pueden visualizar en Google Earth KML y/o conexión al servicio WMS.
   7. Disponibilidad
7. Acerca de este documento
   1. Fecha de creación o última actualización
      05-09-2016
   2. Fecha de última revisión
   3. Fecha de la siguiente revisión
   4. Información de contacto

      Jordi Parpal

      jparpal@conabio.gob.mx>

      Administrador de Metadatos

      Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad

      Liga Periférico Insurgentes Sur Num. 4903 1er piso. Col. Parques del Pedregal. Delg. Tlalpan, D.F., 14010, México

      Teléfono: 01 55 5004 4947 y (fax) 50044931

      Horario de servicio: Lunes a Viernes de 8 a 18 hrs.

   5. Nombre del estándar de contenido
      FGDC Biological Data Profile of the Content Standard for Digital Geospatial Metadata
   6. Versión del estándar de contenido
      FGDC-STD-001.1-1999
   7. Uso horario
   8. Condiciones de acceso
   9. Condiciones de uso
   10. Restricciones de seguridad o privacidad
   11. Extensiones

COMISIÓN NACIONAL PARA EL CONOCIMIENTO Y USO DE LA BIODIVERSIDAD

Av. Liga Periférico – Insurgentes Sur No. 4903. Col. Parques del Pedregal. Del. Tlalpan. 14010. México, DF. Tel. (55) 5004-5018 y (55) 5004-4938. Correo electrónico ssig@conabio.gob.mx

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